东莞轨道交通为国内首条120km/h轨道交通市域快线，它以轨道交通为骨干，有效衔接国铁、城际线和常规公交，使各种交通方式协调发展，实现“内聚、外联”功能。
轨道交通r1线工程概况
r1线一期工程（望洪站至黄江中心站）线路长度为58.285km，其中高架线27.8km，占线路总长的47.7%；地下线27.95km，占线路总长的47.95%，地面线及过渡段2.54km，占线路总长的4.35%。全线共设车站21座，其中高架车站9座，地下车站12座，平均站间距2.863km。在道滘镇污水处理厂南侧设停车场1座，在黄江镇莞深高速公路黄江收费站南侧设黄江车辆段1座。
全线共有5座车站分别与其它轨道交通线、城际线、铁路换乘，分别是：望洪站（与穗莞深、佛莞城际线换乘）、东城南站（与莞惠城际线换乘）、鸿福路站（与r2线换乘）、松山湖站（与r3线换乘）、黄江中心站（与r4线换乘）。工程总投资346.38亿，建设工期为5年，预计2017年建成通车。
轨道交通r2线工程概况
东莞轨道交通r2线首建线路（东莞火车站～虎门火车站段）总长37.787km，其中地下线长33.602km，占线路总长的88.92%，高架线长3.770km，占线路总长的9.98%，路基段长0.415km，占线路总长的1.10%，全线共设车站15座，平均站间距2.632km，最大站间距为5.073km。在东城街道茶山站西侧设车辆段1座，控制中心设于西平站西北侧，全线共设置2座主变电所。
全线共有4座车站分别与其它轨道交通线及铁路线换乘，分别是：东莞火车站（与广深铁路换乘），鸿福路站（与r1线换乘）、西平站（与莞惠城际线换乘）、虎门火车站（与广深港客运专线、穗莞深城际线换乘）。工程总投资180.12亿，建设工期为5年，预计2015年下半年建成通车。
轨道交通r3线工程概况
r3线工程线路长度为66.221km，其中高架线29.66km，占线路总长的44.78%；地下线35.03km，占线路总长的52.9%，地面线及过渡段1.54km，占线路总长的2.32%。本次设计全线共设车站24座，其中高架车站10座，地下车站14座，平均站间距2.822km。在大岭山镇中惠沁林山庄西侧设停车场1座，常平镇骏发一路北侧设常平车辆段1座，企石镇北部东江南岸设停车场1座。
全线共有6座车站分别与其它轨道交通线、城际线、铁路换乘，分别是：长安新区站（与r2线换乘）、长安金沙站（与穗莞深城际线换乘）、松山湖站（与r1线换乘）、松山湖北站（与莞惠城际线换乘）、东莞南站（与广深铁路换乘）、东莞东站（与京九铁路换乘）。工程总投资370.11亿，建设工期为5年，预计2019年建成一期工程（长安新区南站至东莞东站），2021年建成二期工程（东莞东站至企石博厦站）。
中铁二院承担主要工作
1、参与《东莞城市轨道交通建设规划》编制工作，以及城市轨道交通线网规划研究工作。
2、承担东莞轨道交通r1、r2、r3、r4线工程预可行性研究工作。
3、承担r1、r2、r3线工程可行性研究以及相关支持性文件的编制工作。
4、承担r2线勘察设计总承包工作，包括总体总包管理、土建工点设计、全部系统设计、地质勘查和初测定测以及相关技术专题研究工作。
5、参加轨道交通综合体规划研究和勘察设计工作。